Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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