Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms