Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Speer4aF8VPX6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms