Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28305F6U473 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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