Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Pdzd2E9Q1M1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Pdzd2E9Q1M1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Pdzd2E9Q1M1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Pdzd2E9Q1M1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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