Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms