Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc17E9PVB5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc17E9PVB5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms