Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh8D3Z6W3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms