Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Phf11cB4XVP9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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