Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6133B2RY53 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6133B2RY53 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms