Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usf3B2RUQ2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Usf3B2RUQ2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Usf3B2RUQ2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Usf3B2RUQ2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Usf3B2RUQ2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usf3B2RUQ2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms