Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprsB0V2N1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms