Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Syndig1A2ANU3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms