Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
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