Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb3Q9R1P1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms