Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapbQ9QY76 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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