Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp1Q9QY53 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp1Q9QY53 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms