Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmQ9QXG2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms