Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tgm1Q9JLF6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tgm1Q9JLF6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tgm1Q9JLF6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms