Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn5Q9JL35 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Hmgn5Q9JL35 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Hmgn5Q9JL35 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn5Q9JL35 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms