Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ybx3Q9JKB3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ybx3Q9JKB3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms