Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1fQ9JIS7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms