Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rb1cc1Q9ESK9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms