Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc4Q9ES56 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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