Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms