Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp5Q9D7S9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms