Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Polr2dQ9D7M8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2dQ9D7M8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms