Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2310002L09RikQ9D7L5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms