Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns2Q9D7J7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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