Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Stx17Q9D0I4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx17Q9D0I4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms