Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrs1Q9CYH6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrs1Q9CYH6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms