Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms