Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms