Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpa3Q9CQ71 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpa3Q9CQ71 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms