Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl17Q9CPR4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms