Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup155Q99P88 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms