Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms