Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gins4Q99LZ3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gins4Q99LZ3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gins4Q99LZ3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms