Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Chmp1b1Q99LU0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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