Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmed9Q99KF1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms