Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms