Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1bQ91YK2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms