Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csde1Q91W50 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms