Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39cQ8VE09 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms