Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga1Q8R0H9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms