Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phc3Q8CHP6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms