Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik4Q8BMF5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms