Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BGC1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms