Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zbed4Q80WQ9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zbed4Q80WQ9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zbed4Q80WQ9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zbed4Q80WQ9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zbed4Q80WQ9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zbed4Q80WQ9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zbed4Q80WQ9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Zbed4Q80WQ9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Zbed4Q80WQ9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Zbed4Q80WQ9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Zbed4Q80WQ9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Zbed4Q80WQ9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Zbed4Q80WQ9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Zbed4Q80WQ9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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