Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sbno2Q7TNB8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sbno2Q7TNB8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms